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for query gene Cpin_5318 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5318  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 		 402 aa  794    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  48.41 
 
 		 411 aa  342  8e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.5 
 
 		 409 aa  329  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.25 
 
 		 409 aa  317  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.04 
 
 		 409 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.5 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.67 
 
 		 409 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.09 
 
 		 403 aa  289  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.95 
 
 		 410 aa  288  9e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.04 
 
 		 414 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.33 
 
 		 411 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.33 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  40.46 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.46 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.59 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.72 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  40.15 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  38.73 
 
 		 398 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  37.02 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.68 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.73 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.56 
 
 		 396 aa  239  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  40.71 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.07 
 
 		 393 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.76 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  40.46 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.76 
 
 		 394 aa  236  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.41 
 
 		 401 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.54 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.09 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.7 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.81 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.21 
 
 		 406 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  39.53 
 
 		 392 aa  223  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.31 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  33.7 
 
 		 426 aa  219  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.95 
 
 		 418 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  35.39 
 
 		 419 aa  216  7e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.3 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.71 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_1602  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.21 
 
 		 408 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.92 
 
 		 399 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.77 
 
 		 399 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.87 
 
 		 412 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  37.32 
 
 		 413 aa  211  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.92 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.97 
 
 		 399 aa  206  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.43 
 
 		 436 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.36 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.86 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.57 
 
 		 406 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.39 
 
 		 430 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.61 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.68 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.61 
 
 		 424 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.33 
 
 		 412 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_3306  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.41 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.59 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.13 
 
 		 398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  35.71 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.24 
 
 		 392 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.69 
 
 		 408 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.13 
 
 		 416 aa  196  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.26 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.29 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.66 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.03 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_3518  MFS permease  31.9 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.07 
 
 		 440 aa  189  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1358  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.4 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  31.37 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.82 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.43 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1389  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.66 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0010399  normal  0.0253639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  36.78 
 
 		 414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.51 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  37.23 
 
 		 402 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.88 
 
 		 419 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.88 
 
 		 419 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.88 
 
 		 416 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.85 
 
 		 435 aa  182  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.88 
 
 		 416 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.88 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.88 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.4 
 
 		 407 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  30.36 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.88 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.88 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.25 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.32 
 
 		 405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.81 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.12 
 
 		 458 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.32 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.34 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.32 
 
 		 405 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 461 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.91 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  37.37 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.77 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.12 
 
 		 434 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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