More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3595 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  100 
 
 		 404 aa  776    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  59.65 
 
 		 399 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  61.27 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  59.3 
 
 		 399 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  62 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.02 
 
 		 412 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  58.51 
 
 		 412 aa  431  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  58.88 
 
 		 403 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  61 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  56 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  56.78 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_009505  BOV_1358  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  55.75 
 
 		 403 aa  398  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  56.99 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.98 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  41.32 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  38.62 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  39.64 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  40.41 
 
 		 392 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  40.15 
 
 		 392 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.05 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.62 
 
 		 398 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.93 
 
 		 394 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.13 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.67 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  39.44 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.44 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_011989  Avi_3518  MFS permease  37.56 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.21 
 
 		 401 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.44 
 
 		 393 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.25 
 
 		 435 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.52 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.52 
 
 		 404 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.86 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.21 
 
 		 398 aa  222  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.37 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.21 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.56 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.52 
 
 		 399 aa  220  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.47 
 
 		 418 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.63 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.6 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.87 
 
 		 400 aa  216  5e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.85 
 
 		 412 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.09 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.81 
 
 		 498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.34 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.43 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.14 
 
 		 403 aa  212  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  35.28 
 
 		 420 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.03 
 
 		 424 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.71 
 
 		 389 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.51 
 
 		 410 aa  209  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  33.89 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.46 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.34 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.1 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.56 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.93 
 
 		 461 aa  206  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  39.14 
 
 		 392 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.73 
 
 		 402 aa  205  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.07 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.29 
 
 		 407 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  37.43 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.11 
 
 		 414 aa  203  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
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NC_007953  Bxe_C1261  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.73 
 
 		 401 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0278283 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.2 
 
 		 409 aa  202  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.19 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1190  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.86 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.19 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.96 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.01 
 
 		 396 aa  200  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.98 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.86 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.68 
 
 		 401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2514  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.23 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.2 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.2 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.01 
 
 		 416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.08 
 
 		 409 aa  197  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.88 
 
 		 399 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.62 
 
 		 416 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.68 
 
 		 420 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.66 
 
 		 411 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.01 
 
 		 416 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.01 
 
 		 416 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.62 
 
 		 398 aa  196  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.01 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.01 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.86 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.41 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_1602  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.23 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  33.43 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_22050  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.18 
 
 		 437 aa  193  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.972538 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.69 
 
 		 405 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.06 
 
 		 407 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.69 
 
 		 405 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.1 
 
 		 405 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.1 
 
 		 458 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.27 
 
 		 396 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.89 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
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