More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15670 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 		 396 aa  769    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1389  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.14 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0010399  normal  0.0253639 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0291  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.16 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1367  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.53 
 
 		 425 aa  243  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  41.08 
 
 		 411 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  38.69 
 
 		 416 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5245  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.78 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.78 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.9 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.89 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_5624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.98 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598733  normal  0.403775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.81 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.48 
 
 		 416 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2514  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.4 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  38.63 
 
 		 416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.63 
 
 		 419 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.9 
 
 		 416 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.9 
 
 		 416 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.42 
 
 		 419 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  38.63 
 
 		 416 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  38.63 
 
 		 416 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002976  SERP1947  tcaB protein  36.14 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.17 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.68 
 
 		 412 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3301  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.7 
 
 		 403 aa  216  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.99 
 
 		 425 aa  215  9e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  38.21 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.87 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  35.22 
 
 		 398 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.52 
 
 		 398 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  37.67 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  38.87 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.41 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.58 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.16 
 
 		 417 aa  206  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1190  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.3 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.6 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.92 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.33 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.58 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.97 
 
 		 408 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.41 
 
 		 401 aa  202  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  36.36 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.96 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.36 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.66 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.97 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  35.22 
 
 		 392 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.7 
 
 		 402 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.7 
 
 		 402 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  35.22 
 
 		 392 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.73 
 
 		 411 aa  199  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.07 
 
 		 393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.01 
 
 		 414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.85 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  36 
 
 		 426 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_013235  Namu_1251  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.19 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0659251  normal  0.330934 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.13 
 
 		 412 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.78 
 
 		 412 aa  192  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.15 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.86 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.87 
 
 		 424 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.4 
 
 		 400 aa  189  7e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  35.29 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.26 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_3036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.24 
 
 		 414 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
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NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.21 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
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NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.9 
 
 		 403 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.33 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.29 
 
 		 406 aa  186  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.1 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.6 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.51 
 
 		 394 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.22 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002976  SERP2014  bicyclomycin resistance protein  31.69 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0373482  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.24 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4345  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.95 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  36.62 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.19 
 
 		 413 aa  182  7e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.97 
 
 		 436 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.53 
 
 		 407 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22050  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.41 
 
 		 437 aa  182  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.972538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.04 
 
 		 402 aa  182  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  32.97 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  36.39 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.41 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.41 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.47 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  30.67 
 
 		 392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.38 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.95 
 
 		 406 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.18 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.83 
 
 		 401 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.52 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  32.79 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  35.58 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.97 
 
 		 393 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.68 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.61 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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