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for query gene Vapar_2897 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 
396 aa  759    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  71.65 
 
 
412 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  71.65 
 
 
412 aa  531  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  72.63 
 
 
436 aa  514  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  71.46 
 
 
406 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  64.43 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  62.53 
 
 
403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  61.62 
 
 
399 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  60.31 
 
 
399 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  61.71 
 
 
404 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.49 
 
 
403 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1358  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.24 
 
 
403 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  53.55 
 
 
399 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.9 
 
 
396 aa  285  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  43.01 
 
 
407 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  41.26 
 
 
426 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.24 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.92 
 
 
394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  43.64 
 
 
392 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.51 
 
 
398 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  43.6 
 
 
392 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.63 
 
 
418 aa  239  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.24 
 
 
393 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.25 
 
 
406 aa  236  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.65 
 
 
424 aa  236  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  40.72 
 
 
398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.08 
 
 
435 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.71 
 
 
412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_3518  MFS permease  39.29 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.75 
 
 
401 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.55 
 
 
393 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  42.03 
 
 
393 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.03 
 
 
393 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.87 
 
 
412 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.38 
 
 
418 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.73 
 
 
414 aa  227  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.1 
 
 
412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.96 
 
 
398 aa  225  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.78 
 
 
498 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  36.18 
 
 
420 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.47 
 
 
411 aa  222  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.78 
 
 
404 aa  222  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.9 
 
 
405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  39.74 
 
 
392 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.99 
 
 
400 aa  218  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  38 
 
 
416 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.75 
 
 
398 aa  216  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  37.92 
 
 
426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5318  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.5 
 
 
402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.44 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.17 
 
 
405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.91 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.5 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.51 
 
 
401 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.91 
 
 
399 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.76 
 
 
405 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40 
 
 
407 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.91 
 
 
410 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.62 
 
 
384 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.64 
 
 
405 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.34 
 
 
409 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.64 
 
 
458 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.21 
 
 
389 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.64 
 
 
405 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.87 
 
 
417 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38 
 
 
419 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  38.1 
 
 
416 aa  209  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.07 
 
 
419 aa  209  9e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0372929 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  38.35 
 
 
416 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  38.35 
 
 
416 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.57 
 
 
401 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.78 
 
 
408 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.73 
 
 
424 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.35 
 
 
416 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.1 
 
 
419 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.35 
 
 
416 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.39 
 
 
437 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.84 
 
 
416 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  35.52 
 
 
419 aa  205  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.54 
 
 
417 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22050  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.72 
 
 
437 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.972538 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2514  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40 
 
 
397 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.9 
 
 
430 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.41 
 
 
404 aa  204  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  39.39 
 
 
411 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  37.01 
 
 
409 aa  202  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.44 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.06 
 
 
416 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.99 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.93 
 
 
409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3096  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.67 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673947  normal 
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.86 
 
 
411 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.74 
 
 
397 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.4 
 
 
409 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.84 
 
 
392 aa  199  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.36 
 
 
408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.39 
 
 
461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.06 
 
 
407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.75 
 
 
413 aa  197  3e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.15 
 
 
393 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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