More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4173 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 400 aa  782    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  64.03 
 
 		 396 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  63.07 
 
 		 404 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.74 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  57.39 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  58.87 
 
 		 399 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  60.26 
 
 		 412 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  60 
 
 		 412 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  60.51 
 
 		 406 aa  411  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  56.5 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1358  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  56.75 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  60.05 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  53.87 
 
 		 399 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.85 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  41.69 
 
 		 426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.88 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3518  MFS permease  41.09 
 
 		 401 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.49 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  42.86 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  40.47 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  40.63 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  39.43 
 
 		 398 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.69 
 
 		 394 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.16 
 
 		 393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.16 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.15 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  39.95 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.95 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.88 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.69 
 
 		 393 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.73 
 
 		 401 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.98 
 
 		 418 aa  239  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.02 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.66 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.57 
 
 		 412 aa  232  8.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.36 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.08 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.36 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.6 
 
 		 498 aa  229  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.85 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.41 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.33 
 
 		 412 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35 
 
 		 413 aa  226  8e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.05 
 
 		 394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  38.54 
 
 		 416 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.57 
 
 		 418 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.32 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.51 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2514  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.1 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  40.32 
 
 		 392 aa  219  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.86 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.86 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.76 
 
 		 403 aa  219  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.06 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.32 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.32 
 
 		 416 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.32 
 
 		 419 aa  217  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  38.32 
 
 		 416 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.32 
 
 		 416 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  38.32 
 
 		 416 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.6 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  38.28 
 
 		 416 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.63 
 
 		 435 aa  216  8e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.22 
 
 		 400 aa  215  9e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.44 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.33 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.6 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.58 
 
 		 396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.66 
 
 		 398 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1190  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.3 
 
 		 396 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  34.96 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.16 
 
 		 409 aa  210  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.95 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.04 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.83 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3301  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.64 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.29 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.37 
 
 		 409 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  35.84 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.73 
 
 		 401 aa  203  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.13 
 
 		 414 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.98 
 
 		 405 aa  202  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3306  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.31 
 
 		 404 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.55 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.55 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.47 
 
 		 408 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  39.22 
 
 		 411 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.95 
 
 		 396 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.95 
 
 		 396 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.24 
 
 		 393 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.99 
 
 		 392 aa  199  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.95 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.95 
 
 		 396 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.95 
 
 		 396 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
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NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.85 
 
 		 396 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007953  Bxe_C1261  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.14 
 
 		 401 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0278283 
 
 
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NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.34 
 
 		 414 aa  196  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.14 
 
 		 398 aa  196  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.87 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.9 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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