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for query gene Cpin_0109 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 		 409 aa  811    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  60.39 
 
 		 409 aa  495  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  57.21 
 
 		 409 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  57.7 
 
 		 409 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  51.19 
 
 		 411 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.63 
 
 		 410 aa  391  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  47.78 
 
 		 416 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  38.42 
 
 		 426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.83 
 
 		 403 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.61 
 
 		 498 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.32 
 
 		 411 aa  250  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5318  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.67 
 
 		 402 aa  250  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.75 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.2 
 
 		 414 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.12 
 
 		 406 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.42 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.49 
 
 		 394 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  35.28 
 
 		 407 aa  239  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.01 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  36.39 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  36.63 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.73 
 
 		 398 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.91 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.31 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  36.32 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.71 
 
 		 393 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.34 
 
 		 401 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  33.43 
 
 		 426 aa  222  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.11 
 
 		 419 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  32.02 
 
 		 413 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  37.37 
 
 		 392 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.57 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.55 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  36.29 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.29 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  34.44 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.02 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.89 
 
 		 461 aa  213  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.49 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.21 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.82 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.8 
 
 		 392 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.73 
 
 		 412 aa  202  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.39 
 
 		 436 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.77 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.47 
 
 		 412 aa  201  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.25 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.29 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.51 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.92 
 
 		 435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.94 
 
 		 399 aa  196  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.17 
 
 		 401 aa  196  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_1602  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.34 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.44 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.64 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.38 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.98 
 
 		 399 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  30.91 
 
 		 420 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.13 
 
 		 399 aa  192  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  31.55 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.43 
 
 		 412 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.41 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.98 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.78 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 400 aa  188  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.76 
 
 		 420 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.3 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  34.04 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.71 
 
 		 393 aa  186  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.27 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.24 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.11 
 
 		 405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4889  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.69 
 
 		 419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.38 
 
 		 395 aa  182  6e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.42 
 
 		 438 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.2 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.07 
 
 		 417 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.81 
 
 		 405 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.54 
 
 		 434 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.53 
 
 		 412 aa  179  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.15 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  33.88 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.54 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  34.31 
 
 		 416 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  30.94 
 
 		 404 aa  178  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.17 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.35 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.35 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
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NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.43 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.72 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
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NC_011145  AnaeK_3306  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.07 
 
 		 404 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003780  permease  31.02 
 
 		 400 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31 
 
 		 458 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.48 
 
 		 401 aa  176  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.73 
 
 		 405 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  34.32 
 
 		 416 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.04 
 
 		 416 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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