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for query gene Tcr_0876 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 405 aa  803    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.93 
 
 		 405 aa  280  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.17 
 
 		 395 aa  253  6e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 		 414 aa  209  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 409 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.31 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.99 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  33.43 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.56 
 
 		 409 aa  202  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.15 
 
 		 418 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.54 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.38 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3300  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.74 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.29 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.12 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.71 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.4 
 
 		 401 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.71 
 
 		 458 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1912  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.78 
 
 		 408 aa  193  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758085  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.71 
 
 		 405 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.59 
 
 		 418 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_1316  major facilitator superfamily permease  34.29 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323105 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.43 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  36.04 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.71 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.43 
 
 		 405 aa  190  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.12 
 
 		 411 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.62 
 
 		 409 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.98 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  34.71 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  32.12 
 
 		 393 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2043  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.69 
 
 		 406 aa  186  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.678536  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.12 
 
 		 393 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  30.69 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.72 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.77 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_1629  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.52 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.2 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  31.77 
 
 		 392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.4 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.49 
 
 		 392 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.39 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.89 
 
 		 397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_2017  bicyclomycin resistance protein  33.7 
 
 		 401 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.470067  normal  1 
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 408 aa  179  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_1777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.79 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221977  normal  1 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.09 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003780  permease  30.49 
 
 		 400 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_3036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.93 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
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NC_009831  Ssed_2665  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.84 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126331  hitchhiker  0.00560959 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.27 
 
 		 392 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2136  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.15 
 
 		 406 aa  176  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.84 
 
 		 461 aa  176  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.43 
 
 		 403 aa  176  7e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_1956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.68 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  0.0575166 
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.2 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.97 
 
 		 424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.84 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.51 
 
 		 430 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.05 
 
 		 416 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.86 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1974  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.4 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0583224  hitchhiker  0.00000495427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.8 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.8 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  32.76 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.61 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2373  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.96 
 
 		 407 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.409175  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.8 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.51 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.63 
 
 		 407 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00781  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.77 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2488  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.63 
 
 		 407 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0118329  hitchhiker  0.000775175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.78 
 
 		 408 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.51 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.79 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1176  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.43 
 
 		 412 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394639  normal  0.0393311 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2268  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.44 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.4 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.1 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4611  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  29.05 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.68 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.68 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.95 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.51 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.51 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.51 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.51 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.76 
 
 		 411 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.51 
 
 		 396 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.76 
 
 		 411 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.51 
 
 		 399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.14 
 
 		 416 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  30.06 
 
 		 409 aa  166  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1751  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.88 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0172421  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1831  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.88 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.77 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.1 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.29 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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