More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1475 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 
405 aa  808    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.43 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.7 
 
 
395 aa  273  3e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.94 
 
 
401 aa  248  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  36.9 
 
 
400 aa  229  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  37.17 
 
 
401 aa  229  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.63 
 
 
400 aa  226  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.47 
 
 
418 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  36.04 
 
 
414 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1316  major facilitator superfamily permease  37.89 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323105 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  35 
 
 
370 aa  220  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.4 
 
 
396 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  35.91 
 
 
402 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.72 
 
 
402 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.44 
 
 
409 aa  217  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.77 
 
 
405 aa  216  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  36.31 
 
 
426 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  38.71 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  38.98 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.73 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.31 
 
 
392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.88 
 
 
401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.88 
 
 
399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.96 
 
 
410 aa  212  7.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.31 
 
 
400 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.88 
 
 
399 aa  212  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.23 
 
 
407 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221977  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  35 
 
 
393 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3300  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.53 
 
 
400 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.77 
 
 
398 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.25 
 
 
401 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  34.18 
 
 
420 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  35.19 
 
 
398 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.89 
 
 
403 aa  206  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.34 
 
 
398 aa  206  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.67 
 
 
396 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.83 
 
 
418 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.96 
 
 
408 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.27 
 
 
393 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.11 
 
 
399 aa  203  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.43 
 
 
414 aa  202  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2017  bicyclomycin resistance protein  36.06 
 
 
401 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.470067  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.16 
 
 
411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2665  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.48 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126331  hitchhiker  0.00560959 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.16 
 
 
498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.15 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.85 
 
 
394 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.5 
 
 
396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 
405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.5 
 
 
396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  35.57 
 
 
393 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.57 
 
 
393 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 
405 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.55 
 
 
405 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.37 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.28 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  33.25 
 
 
426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.55 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.58 
 
 
424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.94 
 
 
406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.42 
 
 
411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.55 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 
434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.97 
 
 
424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.71 
 
 
397 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  35.67 
 
 
407 aa  196  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.81 
 
 
409 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4611  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  35.31 
 
 
422 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.02 
 
 
405 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.76 
 
 
414 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.37 
 
 
396 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.37 
 
 
396 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.52 
 
 
414 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.37 
 
 
396 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1912  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.19 
 
 
408 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758085  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.03 
 
 
396 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.03 
 
 
396 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.37 
 
 
396 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  32.03 
 
 
396 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.03 
 
 
396 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  38.53 
 
 
392 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.37 
 
 
396 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.03 
 
 
396 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.03 
 
 
396 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  35.63 
 
 
409 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 
411 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3096  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.77 
 
 
406 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673947  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.76 
 
 
416 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.83 
 
 
398 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.68 
 
 
416 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.43 
 
 
402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1974  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.27 
 
 
407 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0583224  hitchhiker  0.00000495427 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2136  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.73 
 
 
406 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2043  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.79 
 
 
406 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.678536  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.71 
 
 
396 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3182  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.33 
 
 
395 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1629  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.31 
 
 
406 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.27 
 
 
407 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2488  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.27 
 
 
407 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0118329  hitchhiker  0.000775175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2373  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.01 
 
 
407 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.409175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>