More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02071 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  100 
 
 
396 aa  787    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 
396 aa  787    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  93.69 
 
 
396 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  99.49 
 
 
396 aa  785    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  99.49 
 
 
396 aa  785    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  88.86 
 
 
398 aa  669    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  100 
 
 
396 aa  787    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  100 
 
 
396 aa  787    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  93.94 
 
 
396 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  93.69 
 
 
396 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  93.94 
 
 
396 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  93.69 
 
 
396 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  100 
 
 
396 aa  787    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  787    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  68.69 
 
 
399 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  68.43 
 
 
399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  69.21 
 
 
401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  70.15 
 
 
396 aa  568  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  69.31 
 
 
402 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  70.92 
 
 
396 aa  544  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  65.05 
 
 
393 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  66.24 
 
 
398 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  50.67 
 
 
401 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  48.3 
 
 
400 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  48.2 
 
 
395 aa  345  5e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  47.78 
 
 
400 aa  345  8e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  47.53 
 
 
401 aa  343  4e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  44.29 
 
 
403 aa  312  5.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  41.89 
 
 
370 aa  298  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.24 
 
 
397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.24 
 
 
405 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.24 
 
 
458 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.98 
 
 
405 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.19 
 
 
405 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.92 
 
 
434 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.13 
 
 
405 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.66 
 
 
405 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  35.95 
 
 
426 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  36.98 
 
 
414 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  37.4 
 
 
402 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.55 
 
 
411 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.13 
 
 
411 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  34.11 
 
 
420 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  36.08 
 
 
411 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.08 
 
 
411 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.08 
 
 
411 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.78 
 
 
416 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  35.77 
 
 
426 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3096  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.34 
 
 
406 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673947  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  35.03 
 
 
409 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.34 
 
 
402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.76 
 
 
400 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.53 
 
 
414 aa  222  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.76 
 
 
400 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.76 
 
 
400 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.76 
 
 
400 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.89 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.63 
 
 
406 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.12 
 
 
424 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.5 
 
 
405 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.69 
 
 
498 aa  216  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.28 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.04 
 
 
408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.92 
 
 
412 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.98 
 
 
420 aa  209  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.31 
 
 
416 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  32.56 
 
 
392 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.57 
 
 
398 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  32.3 
 
 
392 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.3 
 
 
417 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.22 
 
 
410 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.78 
 
 
405 aa  202  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.86 
 
 
400 aa  202  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.36 
 
 
409 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.39 
 
 
398 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.45 
 
 
416 aa  200  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.69 
 
 
394 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.11 
 
 
409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.79 
 
 
409 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.95 
 
 
418 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.83 
 
 
416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.83 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.83 
 
 
416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.83 
 
 
419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.83 
 
 
416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1629  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.28 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.83 
 
 
416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.83 
 
 
416 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.61 
 
 
424 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.83 
 
 
416 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.43 
 
 
403 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.1 
 
 
400 aa  195  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.43 
 
 
394 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.21 
 
 
410 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.51 
 
 
412 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.51 
 
 
412 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2043  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.85 
 
 
406 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.678536  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.72 
 
 
415 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.179817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>