165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1378 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1378  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 389 aa  770    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000192638  hitchhiker  0.00000000000893216 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  64.19 
 
 		 391 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  29.05 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  23.79 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  24.04 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  23.79 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  26.76 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  24.28 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.37 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  24.04 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.04 
 
 		 505 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  27.2 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  24.61 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  23.79 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  24.08 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  24.02 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.94 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.94 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.94 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.94 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.94 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.6 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  25.39 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  25.39 
 
 		 399 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  24.3 
 
 		 399 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  24.61 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  24.3 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  24.3 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  24.3 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  24.3 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  23.25 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  27.06 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  25.24 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  26.6 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  26.8 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  24.05 
 
 		 399 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  26.8 
 
 		 396 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  28.37 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  25.7 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2540  major facilitator superfamily permease  27.32 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.937088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  22 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  23.15 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  22.75 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  19.64 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  21.75 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.07 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  25.59 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  25.33 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  23.84 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4948  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  21.89 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  28.16 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  22.77 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2013  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 429 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  21.97 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  20.51 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  22.04 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 408 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  27.27 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  23.63 
 
 		 458 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  27.17 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  26.59 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  26.59 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  26.59 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  26.59 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 455 aa  47  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000092062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>