More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1408 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
401 aa  795    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  77.75 
 
 
391 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  42.28 
 
 
400 aa  331  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  42.86 
 
 
400 aa  330  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  41.84 
 
 
506 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  41.52 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  41.79 
 
 
447 aa  326  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  41.77 
 
 
400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  41.52 
 
 
400 aa  326  5e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  41.52 
 
 
400 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  41.58 
 
 
506 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  41.84 
 
 
505 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  41.77 
 
 
399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  39.06 
 
 
381 aa  290  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  39.32 
 
 
399 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  39.06 
 
 
381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  39.06 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  38.8 
 
 
381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  38.54 
 
 
381 aa  279  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  38.02 
 
 
381 aa  279  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  38.02 
 
 
381 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  38.02 
 
 
381 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  38.02 
 
 
381 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 
396 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 
404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  34.77 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  33.76 
 
 
399 aa  230  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  33.33 
 
 
399 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  33.76 
 
 
399 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  33.76 
 
 
399 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  33.76 
 
 
399 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  33.76 
 
 
399 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  33.25 
 
 
399 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  33.59 
 
 
399 aa  229  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
399 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  33.5 
 
 
399 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  31.09 
 
 
405 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  31.17 
 
 
396 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  31.17 
 
 
396 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  31.17 
 
 
396 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  31.51 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  31.51 
 
 
396 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  31.94 
 
 
392 aa  177  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  30.24 
 
 
392 aa  170  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
401 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
396 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2540  major facilitator superfamily permease  32.59 
 
 
405 aa  159  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.937088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 
421 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 
408 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 
410 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  29.25 
 
 
402 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  28.65 
 
 
411 aa  155  8e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  29.2 
 
 
397 aa  153  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  31.04 
 
 
402 aa  152  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
415 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  29.92 
 
 
400 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  27.59 
 
 
403 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 
419 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  27.59 
 
 
403 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  29.33 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  27.78 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  29.12 
 
 
412 aa  139  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  29.89 
 
 
409 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  28.64 
 
 
410 aa  133  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  27.39 
 
 
390 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  29.4 
 
 
411 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 
419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  28.06 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  27.34 
 
 
390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  24.65 
 
 
391 aa  117  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 
410 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  23.36 
 
 
387 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  27.84 
 
 
376 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  27.46 
 
 
392 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  28.61 
 
 
392 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  28.35 
 
 
392 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  26.85 
 
 
392 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  28.35 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  24.94 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  24.73 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  24.94 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  23.54 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  28.57 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  28.8 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  24.46 
 
 
390 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  26.13 
 
 
392 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  26.13 
 
 
390 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  29.31 
 
 
388 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  28.53 
 
 
405 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  25.33 
 
 
386 aa  92  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  28.31 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  28.53 
 
 
405 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  28.53 
 
 
419 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1378  major facilitator superfamily permease  24.22 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000192638  hitchhiker  0.00000000000893216 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
392 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  24.26 
 
 
383 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  28.31 
 
 
392 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>