212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3029 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  100 
 
 		 376 aa  713    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1764  major facilitator transporter  46.61 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0115294  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0293  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 443 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.410279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2994  putative transport protein  35.66 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03950  arabinose efflux permease family protein  34.78 
 
 		 430 aa  143  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.538402  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4948  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  24.47 
 
 		 400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1428  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0126102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 400 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  24.47 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28210  arabinose efflux permease family protein  34.41 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.47 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  24.47 
 
 		 506 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  24.87 
 
 		 506 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.66 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 505 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  27.51 
 
 		 381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  27.79 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  27.79 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  27.51 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 415 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  25.86 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  27.51 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  25.86 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  25.86 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  25.86 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  27.22 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  26.68 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  25.78 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  25.5 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  25.29 
 
 		 399 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 386 aa  99.8  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 396 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 396 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  25.43 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 392 aa  90.5  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.98 
 
 		 409 aa  89.7  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1684  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  25.49 
 
 		 402 aa  86.7  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  26.59 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  26.59 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  26.59 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  22.93 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  26.3 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  24.22 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2835  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000987059  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  22.38 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  23.81 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  20.29 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  25 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1256  transporter, putative  24.91 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1996  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.566259  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  21.73 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1377  transporter, putative  24.22 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25.81 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  23.1 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  22.22 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0485  putative transporter  24.57 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.425547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  19.16 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.07 
 
 		 412 aa  57  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  21.53 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  24.46 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  25.08 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  24.5 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>