93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4948 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4948  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
406 aa  774    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2994  putative transport protein  45.87 
 
 
431 aa  271  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0293  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 
443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.410279 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03950  arabinose efflux permease family protein  39.45 
 
 
430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.538402  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28210  arabinose efflux permease family protein  36.15 
 
 
394 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  34.24 
 
 
376 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1764  major facilitator transporter  37.64 
 
 
387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0115294  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2835  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 
379 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000987059  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1428  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0126102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1684  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 
395 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272501  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.99 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.28 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.28 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.7 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.28 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.6 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.28 
 
 
381 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.56 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.86 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  20.49 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  21.75 
 
 
447 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  21.18 
 
 
506 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.13 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  21.67 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  20.2 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  21.23 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  21.18 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  21.41 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  21.64 
 
 
400 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  21.37 
 
 
505 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  21.58 
 
 
506 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  21.16 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  21.89 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  21.81 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  21.81 
 
 
399 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  21.81 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  21.81 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  21.81 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  21.14 
 
 
399 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  21.54 
 
 
399 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  20.54 
 
 
399 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  21.56 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  20.9 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  22.14 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  25.48 
 
 
391 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  21.65 
 
 
392 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  22.81 
 
 
396 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  22.51 
 
 
396 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  23.08 
 
 
405 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  23.08 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  23.08 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  23.08 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  22.17 
 
 
401 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3516  major facilitator transporter  35.5 
 
 
387 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.842174  normal  0.311663 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4359  major facilitator transporter  34.91 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4007  major facilitator transporter  34.91 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.951834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  27.1 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  22.86 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1378  major facilitator superfamily permease  29.55 
 
 
389 aa  50.4  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000192638  hitchhiker  0.00000000000893216 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2540  major facilitator superfamily permease  22.22 
 
 
405 aa  50.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.937088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  21.59 
 
 
415 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
386 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  23.72 
 
 
411 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  36.8 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  26.8 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  25.09 
 
 
386 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  37.62 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  35.04 
 
 
461 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  26.97 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2076  major facilitator transporter  33.15 
 
 
393 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0274454  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  26.81 
 
 
400 aa  47.4  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  23.64 
 
 
409 aa  47  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
436 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
395 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  26.83 
 
 
388 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  25.5 
 
 
388 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  24.32 
 
 
412 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
429 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  27.42 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  36.84 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  26.56 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  40.74 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  30.23 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  31.86 
 
 
394 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  28.46 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 
435 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 
395 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  32.52 
 
 
458 aa  43.1  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>