81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1684 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1684  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
395 aa  716    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272501  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1428  major facilitator superfamily MFS_1  44.82 
 
 
384 aa  189  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0126102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2835  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 
379 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000987059  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4948  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 
406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0293  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 
443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.410279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  34.82 
 
 
376 aa  113  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1764  major facilitator transporter  36.94 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0115294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2994  putative transport protein  36.12 
 
 
431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28210  arabinose efflux permease family protein  33.24 
 
 
394 aa  106  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03950  arabinose efflux permease family protein  31.69 
 
 
430 aa  100  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.538402  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  26.72 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  26.44 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  26.72 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  26.72 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
401 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  26.15 
 
 
381 aa  86.3  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  26.57 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  26.44 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  27.79 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  26.29 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  23.95 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  26.29 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  23.78 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  28.14 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  24.74 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  24.53 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  24.74 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  23.16 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.57 
 
 
505 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  24.74 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  24.74 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  24.74 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  25.26 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  24.47 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  24.5 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  24.47 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.5 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.22 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.79 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  24.5 
 
 
506 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  23.42 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  24.79 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  24.5 
 
 
506 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  26.51 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  27.17 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  23.66 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  27.17 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  27.33 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  27.17 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  26.06 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  27.17 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  29.73 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 
396 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  27.08 
 
 
388 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  22.45 
 
 
384 aa  50.8  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  21.69 
 
 
404 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  22.55 
 
 
383 aa  49.7  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  30.19 
 
 
392 aa  49.7  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  22.6 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  27.95 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  31.05 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4799  major facilitator transporter  28.21 
 
 
405 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  30.74 
 
 
400 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.67 
 
 
578 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  28.64 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  22.44 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  28.99 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00900  Major Facilitator Superfamily transporter  30.7 
 
 
353 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 
534 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.48 
 
 
646 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.48 
 
 
646 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  32.28 
 
 
414 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.03 
 
 
505 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 
646 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
421 aa  43.5  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  34.82 
 
 
410 aa  43.1  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  24.61 
 
 
387 aa  42.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>