63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2835 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2835  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 379 aa  689    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000987059  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1428  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0126102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1684  major facilitator superfamily MFS_1  43.02 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4948  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 406 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0293  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 443 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.410279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2994  putative transport protein  33.88 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03950  arabinose efflux permease family protein  30.88 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.538402  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1764  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 387 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0115294  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28210  arabinose efflux permease family protein  35.08 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  26.29 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  25.64 
 
 		 399 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  25.64 
 
 		 399 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  25.39 
 
 		 399 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  26.02 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  25.13 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  26.02 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  26.02 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  25.77 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.58 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.49 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.31 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.31 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.51 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.31 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.31 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  20.7 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  24.14 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  20.16 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  22.72 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  22.68 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  22.51 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  22.94 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  23.39 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  23.39 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  22.72 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  22.51 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  23.08 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 400 aa  57  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  25 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  29.08 
 
 		 390 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 404 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 477 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  22.08 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  21.5 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  21.57 
 
 		 405 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  21.57 
 
 		 396 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  28.17 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00900  Major Facilitator Superfamily transporter  31.68 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01240  arabinose efflux permease family protein  28.22 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 386 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 434 aa  43.5  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 408 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>