53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0398 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  795    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  81.44 
 
 		 407 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1312  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  21.51 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  20.83 
 
 		 480 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  23.53 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 440 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  21.77 
 
 		 440 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  22.76 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 437 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 411 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 445 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  20.93 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  19.85 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  21.85 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  19.89 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1377  transporter, putative  23.76 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1256  transporter, putative  23.76 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  20.54 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0118  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 433 aa  43.5  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.254663  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 471 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  31.01 
 
 		 420 aa  43.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2514  putative permease  23.45 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0562758  normal  0.125545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.81 
 
 		 410 aa  43.1  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>