136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1764 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1764  major facilitator transporter  100 
 
 		 387 aa  722    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0115294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  46.03 
 
 		 376 aa  255  9e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2994  putative transport protein  36.62 
 
 		 431 aa  159  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0293  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 		 443 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.410279 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03950  arabinose efflux permease family protein  37.6 
 
 		 430 aa  145  8.000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.538402  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4948  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1428  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0126102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  26.96 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28210  arabinose efflux permease family protein  37.01 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  27.18 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  26.96 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 447 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  26.44 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  26.63 
 
 		 506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  26.7 
 
 		 506 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 399 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  25.56 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  26.3 
 
 		 381 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 384 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1684  major facilitator superfamily MFS_1  36.42 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272501  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  26.04 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  25.76 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  26.04 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  25.76 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  26.03 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  25 
 
 		 381 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.48 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2835  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000987059  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  27.9 
 
 		 402 aa  92.8  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  25.68 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  25.68 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  25.68 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  25.68 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  24.74 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  25.68 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  24.49 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  24.28 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  24.28 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  24.86 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  25.26 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  24.72 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  22.56 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.27 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  25.67 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  24.79 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  29.67 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  28.48 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  31.63 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4261  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.861934 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  22.37 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.84 
 
 		 482 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.383869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 408 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.93 
 
 		 554 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 434 aa  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.53 
 
 		 531 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4538  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 498 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  23.1 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.32 
 
 		 497 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>