More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0775 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 385 aa  739    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2048  major facilitator superfamily transporter  28.73 
 
 		 366 aa  97.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 403 aa  93.2  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 396 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25.77 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  23.48 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1776  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  23.2 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1989  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  23.56 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  22.93 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  22.93 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  22.63 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  23.56 
 
 		 505 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.94 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  22.93 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.56 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.66 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.28 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  22.41 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.28 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.2 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2167  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.31 
 
 		 381 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  26.72 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  22.26 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0104  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  28.34 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3303  major facilitator superfamily transporter  26.15 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.176544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  22.67 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0995  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  24.78 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  23.98 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  24.38 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  22.8 
 
 		 419 aa  62.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  20.39 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  22.03 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  20.26 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  20.26 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  21.07 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  21.02 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  20.95 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  20.95 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  21.07 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2468  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  24.93 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  25.64 
 
 		 454 aa  57  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  20.79 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  19.83 
 
 		 384 aa  57  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  30 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  24.73 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>