More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0954 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 435 aa  844    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  51.09 
 
 		 440 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  55.22 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  46.84 
 
 		 421 aa  345  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 		 403 aa  340  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  48.73 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  49.64 
 
 		 423 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  49.64 
 
 		 423 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  49.64 
 
 		 423 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  48.47 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  47.47 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  47.24 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  42.07 
 
 		 403 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 431 aa  209  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 392 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 387 aa  96.7  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.57 
 
 		 477 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  25 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  24.42 
 
 		 506 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.36 
 
 		 477 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 447 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  24.06 
 
 		 400 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.31 
 
 		 400 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  24.54 
 
 		 400 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  24.06 
 
 		 506 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 399 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 505 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  23.92 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  23.66 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  24.53 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  25.06 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.5 
 
 		 528 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  23 
 
 		 685 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  23.6 
 
 		 402 aa  79.7  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.64 
 
 		 615 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  24.87 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.64 
 
 		 523 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  25 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.56 
 
 		 534 aa  76.6  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.12 
 
 		 475 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.81 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.64 
 
 		 540 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.75 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.33 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  25 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  27.09 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.87 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.94 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.86 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 539 aa  74.3  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  23.53 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  20.95 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.7 
 
 		 525 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  26.21 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.38 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 539 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.68 
 
 		 520 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.64 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  25.31 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  32.64 
 
 		 528 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  32.64 
 
 		 528 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.64 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  32.64 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.68 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.64 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>