More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0509 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
403 aa  793    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  54.04 
 
 
402 aa  435  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  49.75 
 
 
406 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  50.26 
 
 
397 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  50.26 
 
 
397 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  48.98 
 
 
397 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  49.49 
 
 
411 aa  384  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  48.95 
 
 
411 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  47.22 
 
 
410 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  48.24 
 
 
408 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  48.24 
 
 
408 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  48.24 
 
 
408 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  48.24 
 
 
408 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  48.49 
 
 
408 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  48.24 
 
 
408 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  48.12 
 
 
409 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  48.83 
 
 
398 aa  361  1e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  50.79 
 
 
400 aa  355  6.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  48.04 
 
 
403 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  47.78 
 
 
403 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  47.78 
 
 
403 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  48.04 
 
 
403 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  48.62 
 
 
404 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  47.4 
 
 
407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  44.78 
 
 
409 aa  343  4e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  48.37 
 
 
404 aa  342  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  48.37 
 
 
404 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  48.37 
 
 
404 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  48.12 
 
 
404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  42.24 
 
 
404 aa  325  7e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  42.39 
 
 
405 aa  306  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  41.81 
 
 
410 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  42.53 
 
 
404 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  39.64 
 
 
431 aa  289  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  38.31 
 
 
487 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  41.01 
 
 
406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
399 aa  279  8e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  42.78 
 
 
404 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  42.78 
 
 
404 aa  276  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  42.78 
 
 
404 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  42.78 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  42.78 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  42.78 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  42.78 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  42.78 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  42.53 
 
 
404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 
413 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  37.02 
 
 
406 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 
413 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.31 
 
 
416 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  35.98 
 
 
416 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  39.19 
 
 
389 aa  243  6e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  36.23 
 
 
401 aa  241  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  35.1 
 
 
418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  34.45 
 
 
420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 
407 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  35.11 
 
 
415 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  34.43 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 
410 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  35.28 
 
 
412 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  34.9 
 
 
394 aa  203  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  34.38 
 
 
394 aa  203  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  34.29 
 
 
407 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 
404 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  30.26 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  26.49 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  26.49 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  27.39 
 
 
408 aa  106  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  26.91 
 
 
411 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  26.35 
 
 
411 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  27.09 
 
 
411 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
411 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  26.53 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  26.53 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25.82 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  26.53 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
435 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  21.79 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.63 
 
 
409 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  28.63 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  25.43 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  24.08 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  26.23 
 
 
415 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  30.65 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  29.29 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  25.69 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  25.72 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  26.67 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>