More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0840 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
413 aa  799    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  91.48 
 
 
413 aa  740    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  72.96 
 
 
431 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  72.19 
 
 
487 aa  548  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  65.71 
 
 
406 aa  501  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  63.38 
 
 
416 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  64.5 
 
 
411 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  59.85 
 
 
415 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  53.85 
 
 
416 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  53.83 
 
 
423 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  53.71 
 
 
420 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  52.82 
 
 
418 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  44.86 
 
 
410 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  45.71 
 
 
404 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  44.86 
 
 
404 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  44.86 
 
 
404 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  44.86 
 
 
404 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  44.86 
 
 
404 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  44.86 
 
 
404 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  44.86 
 
 
404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  44.86 
 
 
404 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  44.36 
 
 
404 aa  342  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  44.36 
 
 
404 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 
406 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  40.89 
 
 
399 aa  317  3e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  41.04 
 
 
411 aa  309  5.9999999999999995e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 
397 aa  302  9e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 
397 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  42.15 
 
 
397 aa  292  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  40.34 
 
 
408 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  40.34 
 
 
408 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  40.34 
 
 
408 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  40.34 
 
 
408 aa  288  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  40.34 
 
 
408 aa  288  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  40.1 
 
 
408 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  41.8 
 
 
406 aa  285  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  40.24 
 
 
409 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  40.79 
 
 
410 aa  280  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  36.48 
 
 
402 aa  276  6e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  41.71 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  41.71 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  41.45 
 
 
404 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  41.71 
 
 
404 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  41.45 
 
 
404 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  35.79 
 
 
411 aa  268  1e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  40 
 
 
403 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
403 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 
403 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 
403 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  43.04 
 
 
400 aa  266  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  37.3 
 
 
403 aa  251  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  35.16 
 
 
405 aa  251  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  36.07 
 
 
404 aa  249  6e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  35.7 
 
 
407 aa  247  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  34.75 
 
 
398 aa  241  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 
410 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 
395 aa  230  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  35.09 
 
 
409 aa  229  7e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 
406 aa  210  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  33.51 
 
 
394 aa  209  8e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  33.51 
 
 
394 aa  205  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  32.17 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 
404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  34.22 
 
 
389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  32.75 
 
 
407 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  30.11 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  31.76 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  25.63 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  25.63 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.3 
 
 
416 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  26.54 
 
 
428 aa  89  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.28 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 
410 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.87 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  26.1 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.13 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  26.2 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
435 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
415 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  25.06 
 
 
411 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  26.98 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  35.35 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  22.6 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  27.59 
 
 
1833 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.12 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3681  major facilitator transporter  25.4 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
416 aa  73.2  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  25.77 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  30.93 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  25 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  26.05 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  25.4 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>