More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1063 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  84.98 
 
 
412 aa  656    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  100 
 
 
407 aa  787    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  56.93 
 
 
404 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  36.68 
 
 
411 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  35.17 
 
 
397 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  35.17 
 
 
397 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  35.37 
 
 
406 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 
403 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 
399 aa  223  7e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  37.9 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 
397 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  37.97 
 
 
410 aa  216  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 
395 aa  216  8e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  35.7 
 
 
408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 
408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  35.7 
 
 
408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  35.7 
 
 
408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  35.7 
 
 
408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  35.44 
 
 
408 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 
406 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  32.82 
 
 
411 aa  210  4e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  35.86 
 
 
409 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  30.87 
 
 
402 aa  207  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  33.07 
 
 
404 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
423 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  33.77 
 
 
416 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 
413 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  31.66 
 
 
410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  35.95 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  33.86 
 
 
431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  35.95 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  35.95 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  35.7 
 
 
404 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  35.7 
 
 
404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  33.42 
 
 
487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.38 
 
 
416 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 
400 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  31.22 
 
 
398 aa  193  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 
413 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  32.64 
 
 
409 aa  193  5e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  32.03 
 
 
418 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  33.42 
 
 
403 aa  190  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 
406 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  30.99 
 
 
420 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  32.16 
 
 
404 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  32.16 
 
 
404 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  31.91 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  31.91 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  31.91 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  31.91 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  32.73 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  31.91 
 
 
404 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  31.66 
 
 
404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  31.5 
 
 
406 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  31.75 
 
 
411 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  31.44 
 
 
405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
410 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  29.5 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  31.81 
 
 
415 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  35.56 
 
 
450 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  26.51 
 
 
394 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  28.39 
 
 
407 aa  156  6e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  25.98 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 
407 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  30.55 
 
 
389 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  27.53 
 
 
401 aa  137  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  26.87 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  26.87 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  23.43 
 
 
410 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.6 
 
 
395 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  28.53 
 
 
419 aa  99.4  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  27.74 
 
 
405 aa  96.3  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
398 aa  93.2  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.71 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24.27 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 
425 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
406 aa  90.1  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.49 
 
 
387 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  26.46 
 
 
386 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  26.65 
 
 
428 aa  86.3  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  28.68 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  25.62 
 
 
412 aa  84  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
435 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
417 aa  82.8  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  25.13 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  26.62 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  27.22 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  23.65 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  25.95 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  28.07 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  27.19 
 
 
400 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  25.13 
 
 
421 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>