More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2355 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
385 aa  750    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 
400 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  31.38 
 
 
384 aa  178  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 
399 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 
391 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
411 aa  162  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  30.57 
 
 
386 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
420 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  27.5 
 
 
405 aa  139  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  28.12 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  28.27 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  28.27 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  28.01 
 
 
432 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  28.01 
 
 
432 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  28.08 
 
 
409 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  29.43 
 
 
409 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 
388 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  27.4 
 
 
406 aa  116  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
381 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  28.17 
 
 
397 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  25.95 
 
 
474 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  26.29 
 
 
388 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 
407 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  28.49 
 
 
414 aa  99.8  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  25.53 
 
 
404 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
414 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  29.59 
 
 
396 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1730  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 
392 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  24.25 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  27.39 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  24.62 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  24.68 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1767  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
399 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18145 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  25.93 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  24.37 
 
 
423 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  25.77 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  23.81 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  24.37 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  25.99 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  23.14 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25.29 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  25.07 
 
 
398 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  22.75 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 
484 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  23.85 
 
 
400 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 
476 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1602  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
397 aa  77  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.822516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  22.85 
 
 
393 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  28.64 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  23.18 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  33.59 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  33.59 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  23.18 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 
495 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  29.69 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  23.02 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  26.49 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.05 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1846  transporter protein  35.71 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.958956  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 
541 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.05 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  28.28 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.96 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  33.86 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.17 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  26.57 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.6 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 
480 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.17 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.96 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  34.11 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.87 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.6 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  23.25 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  25.71 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.6 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.6 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.78 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.87 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  32.82 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.21 
 
 
469 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  32.82 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  32.82 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.65 
 
 
384 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  32.82 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  28.93 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
538 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.57 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.96 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>