More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1385 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 429 aa  830    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  76.05 
 
 		 430 aa  664    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  53.1 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  56.8 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  28.57 
 
 		 434 aa  89.7  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  28 
 
 		 409 aa  86.7  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3232  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0291  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  27.48 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 392 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 536 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3011  Arabinose efflux permease-like protein  37.69 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.7 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 487 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  35.81 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  23.58 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  24.23 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  30.16 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  26.14 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  23.58 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.47 
 
 		 486 aa  59.7  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  23.76 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  28 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  23.76 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  26.27 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  23.76 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  24.41 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  23.76 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  23.75 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  23.76 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  23.48 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  23.48 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.65 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 497 aa  57  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1475  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.29 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  24.49 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 487 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.13 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15060  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.139374  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3066  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>