More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2461 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 424 aa  818    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  63.73 
 
 		 420 aa  503  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  58.91 
 
 		 418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  60 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  61.15 
 
 		 425 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  56.25 
 
 		 405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  57.71 
 
 		 413 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  56.36 
 
 		 408 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  56.36 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  56.36 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  56.36 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  56.36 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  56.25 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  56.4 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  56.4 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  56.64 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  58.82 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 		 411 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  43.5 
 
 		 435 aa  322  7e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 431 aa  319  7.999999999999999e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  44.15 
 
 		 425 aa  296  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 		 425 aa  296  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 426 aa  293  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 411 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 		 405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  45.05 
 
 		 412 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  45.21 
 
 		 419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 366 aa  156  8e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  29.25 
 
 		 544 aa  138  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 615 aa  124  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  42.17 
 
 		 522 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.92 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  24.19 
 
 		 685 aa  66.6  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0200  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.04 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.04 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.04 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.04 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  23.56 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  29.23 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.52 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  27.01 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.04 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.08 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  27.12 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  22.6 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  28.4 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0673  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.317813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  25 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.39 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  26.59 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  27.54 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  25.48 
 
 		 531 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  25.95 
 
 		 489 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  29.38 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  28.36 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 495 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  26.05 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>