More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0724 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 406 aa  810    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  63.9 
 
 		 401 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 396 aa  227  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 389 aa  205  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  29.71 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 401 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  30.37 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  29.2 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  28.94 
 
 		 403 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  28.94 
 
 		 403 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  29.2 
 
 		 403 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  29.71 
 
 		 403 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  28.68 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  28.68 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  28.68 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  28.68 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  27.53 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 410 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 396 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  28.72 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  29.05 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  30.14 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  28.81 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  28.8 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 410 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  29.08 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  29.08 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  29.08 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  27.49 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  29.08 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  29.08 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  29.08 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  29.08 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  28.49 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  29.59 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  27.53 
 
 		 421 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 398 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  29.41 
 
 		 404 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  28.49 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  26.46 
 
 		 401 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  28.06 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  28.06 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  28.06 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  28.06 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  28.06 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  28.06 
 
 		 406 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  29.23 
 
 		 402 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1320  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  hitchhiker  0.000000456317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  27.97 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>