218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2232 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  92.77 
 
 		 417 aa  752    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  854    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  78.82 
 
 		 420 aa  608  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  59.72 
 
 		 439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  59.72 
 
 		 439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  62.35 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  59.35 
 
 		 425 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  57.88 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  60.65 
 
 		 411 aa  435  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  57.07 
 
 		 439 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  60.3 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  60.91 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  60.05 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  54.57 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  57 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  63.24 
 
 		 421 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  61.89 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  47 
 
 		 423 aa  345  8e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 451 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 		 453 aa  293  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 		 436 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  43.48 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 451 aa  269  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 426 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  40.25 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  40.1 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 		 428 aa  244  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 426 aa  239  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 419 aa  239  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  41.96 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 420 aa  238  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 419 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  35.11 
 
 		 431 aa  230  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 417 aa  229  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  36.97 
 
 		 420 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 438 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  37.99 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  36.99 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 420 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  37.13 
 
 		 449 aa  206  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 452 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  34.46 
 
 		 372 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  28.51 
 
 		 473 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  20.84 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  25.55 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  25.55 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  25.55 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  25.54 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  24.61 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  25.24 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  24.92 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  24.92 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  24.61 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.66 
 
 		 394 aa  55.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 438 aa  53.5  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  20.69 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.83 
 
 		 517 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  24.1 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  24.48 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 497 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 489 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 486 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  24.24 
 
 		 454 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  29.63 
 
 		 548 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.61 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.85 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  24.24 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.61 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>