72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47253 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  100 
 
 		 473 aa  952    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  29.61 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 439 aa  150  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 424 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  29.78 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 424 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 438 aa  127  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 442 aa  126  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 434 aa  126  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 419 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 451 aa  106  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 419 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  24.71 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 453 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 421 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  32.86 
 
 		 420 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  28.25 
 
 		 431 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 417 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 417 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  33.18 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 420 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 422 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  33.18 
 
 		 372 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 420 aa  97.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 420 aa  96.7  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 446 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 416 aa  94.4  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  25.55 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 386 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  21.46 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  24.68 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  20.75 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  29.66 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 414 aa  43.5  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 465 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>