110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1367 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  100 
 
 
372 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  100 
 
 
420 aa  725    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  97.85 
 
 
420 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  97.59 
 
 
422 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  98.12 
 
 
415 aa  594  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  98.12 
 
 
415 aa  594  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  98.12 
 
 
415 aa  594  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  98.12 
 
 
415 aa  594  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  86.79 
 
 
419 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  87.06 
 
 
420 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  87.37 
 
 
419 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  86.02 
 
 
419 aa  557  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  87.37 
 
 
419 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  87.37 
 
 
419 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  86.31 
 
 
419 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  85.75 
 
 
419 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  83.47 
 
 
417 aa  544  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  83.2 
 
 
417 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  48.73 
 
 
451 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  48.73 
 
 
451 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  51.81 
 
 
426 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  47.41 
 
 
453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  48.11 
 
 
416 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  49.3 
 
 
386 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  48.73 
 
 
439 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  48.73 
 
 
451 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  50.3 
 
 
452 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  47.32 
 
 
446 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  46.2 
 
 
453 aa  272  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  35.31 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  34.75 
 
 
423 aa  196  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  35.31 
 
 
417 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  38.12 
 
 
433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  34.46 
 
 
420 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 
411 aa  180  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  36.18 
 
 
424 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  35.41 
 
 
439 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  33.24 
 
 
425 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  33.24 
 
 
418 aa  175  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  35.28 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  33.52 
 
 
420 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  31.81 
 
 
439 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 
439 aa  170  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 
436 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  34.55 
 
 
434 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 
442 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
428 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 
420 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 
438 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 
421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  33.11 
 
 
419 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  31.65 
 
 
403 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  29.97 
 
 
438 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  29.46 
 
 
452 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
417 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  34.44 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
411 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  29.55 
 
 
410 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  26.09 
 
 
431 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 
417 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 
428 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  27.81 
 
 
426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  26.1 
 
 
473 aa  110  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  29.17 
 
 
421 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  31.25 
 
 
449 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  30.3 
 
 
421 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  30.3 
 
 
421 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  28.5 
 
 
405 aa  97.1  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  34.48 
 
 
426 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  28.65 
 
 
406 aa  57.8  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
388 aa  56.6  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  32.26 
 
 
421 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  31.44 
 
 
428 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
414 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
414 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  30 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 
437 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 
437 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
392 aa  49.7  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  31.51 
 
 
412 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  25.37 
 
 
463 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 
403 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  33.08 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
435 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08760  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13880)  29.41 
 
 
542 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194765  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  31.54 
 
 
396 aa  46.6  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  30.97 
 
 
416 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  30.23 
 
 
539 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  31.54 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  27.97 
 
 
398 aa  44.3  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
408 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  29.7 
 
 
476 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  33.33 
 
 
419 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3535  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
406 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156699  normal  0.255134 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  24.65 
 
 
462 aa  43.9  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  30.71 
 
 
407 aa  43.9  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.4 
 
 
526 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>