154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0283 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  838    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  43 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 424 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 424 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  42.38 
 
 		 411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  41.69 
 
 		 417 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 439 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  41.02 
 
 		 439 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  42.46 
 
 		 420 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 		 438 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  39.19 
 
 		 418 aa  252  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 451 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 434 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 451 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  43.25 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  37.68 
 
 		 439 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 		 453 aa  226  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 416 aa  225  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  36.18 
 
 		 417 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 419 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 451 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 419 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 446 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 420 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 386 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 		 436 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  34.38 
 
 		 420 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  36.34 
 
 		 415 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 415 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 415 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 415 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 422 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 420 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  38.69 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 403 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 421 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 428 aa  180  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  36.26 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 438 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 417 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  28.77 
 
 		 431 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 452 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  33.84 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  23.18 
 
 		 473 aa  93.2  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 516 aa  60.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  20.65 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  23.32 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  22.76 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0091  hypothetical protein  25.41 
 
 		 277 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  22.33 
 
 		 392 aa  50.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 516 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000092062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  29.21 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0534  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000100009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 494 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 511 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  21.93 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 489 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 432 aa  46.6  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 408 aa  47  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 584 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  30.19 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  30.19 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  30.19 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  23.17 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  30.19 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000142598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>