129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12481 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  100 
 
 		 418 aa  813    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  62.19 
 
 		 425 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  63.12 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  55.94 
 
 		 417 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  54.57 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  55.47 
 
 		 439 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  58.15 
 
 		 411 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  56.89 
 
 		 442 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  55.39 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  64.14 
 
 		 421 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  55.64 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  55.63 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  57.14 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  63.94 
 
 		 419 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  55.16 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  53.03 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  51.64 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 423 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 		 436 aa  279  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  39.69 
 
 		 451 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 451 aa  260  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 416 aa  249  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  38.72 
 
 		 446 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 426 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  37.02 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 451 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  36.83 
 
 		 439 aa  232  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 433 aa  229  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 421 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 417 aa  213  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  33.58 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 419 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 419 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  38.92 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  34.28 
 
 		 420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  35.19 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  37 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 449 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 438 aa  179  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 452 aa  176  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 417 aa  176  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  33.69 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  29.78 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  35.36 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  24.01 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  24.01 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  24.01 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  25.35 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  23.23 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 454 aa  57  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  22.22 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 454 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 457 aa  53.5  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  21.46 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 458 aa  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  22.16 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.19 
 
 		 495 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.98 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.83 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  20.6 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 		 405 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  28.69 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.32 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0271  major facilitator transporter  21.82 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00524997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.74 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2999  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.0320436 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>