218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3004 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  100 
 
 		 423 aa  816    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  48.54 
 
 		 424 aa  359  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  47 
 
 		 432 aa  345  8e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  48.62 
 
 		 411 aa  343  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  48.08 
 
 		 424 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  47.92 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  47.56 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  47.98 
 
 		 420 aa  332  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  49.59 
 
 		 439 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  50.42 
 
 		 433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  47.07 
 
 		 442 aa  316  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  45.77 
 
 		 418 aa  315  8e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  46.86 
 
 		 434 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  44.12 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 439 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  44.07 
 
 		 439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  50 
 
 		 419 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  43.81 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  49.51 
 
 		 421 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  38.76 
 
 		 453 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 451 aa  260  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 		 451 aa  259  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 426 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 416 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 446 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  42.15 
 
 		 407 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  39.11 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 451 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 420 aa  226  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 421 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 421 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 421 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  39.23 
 
 		 386 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 403 aa  213  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 452 aa  212  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 417 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  34.83 
 
 		 420 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 420 aa  209  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  33.6 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 410 aa  203  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  34.25 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 449 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 426 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  34.18 
 
 		 372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  36.07 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  28.64 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.53 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.17 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.46 
 
 		 495 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  21.12 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  28.97 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  30.06 
 
 		 465 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 465 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0780  major facilitator family transporter  28.28 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114821  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  28.28 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  26.09 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  28.28 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  28.28 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  28.28 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  28.28 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  28.28 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 539 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  21.07 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  27.27 
 
 		 492 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.85 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 486 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 396 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  28.02 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>