275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1837 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  95.41 
 
 
417 aa  659    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
417 aa  812    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  98.8 
 
 
438 aa  802    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  75.64 
 
 
410 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  72.49 
 
 
411 aa  525  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  71.7 
 
 
428 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  71.7 
 
 
449 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  37.44 
 
 
432 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  38.42 
 
 
424 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  37.6 
 
 
417 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  36.88 
 
 
424 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  38.84 
 
 
420 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  37.63 
 
 
420 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  37.37 
 
 
425 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  36.97 
 
 
439 aa  220  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  36.17 
 
 
439 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 
439 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  36.87 
 
 
423 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 
411 aa  205  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 
438 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 
442 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  38.23 
 
 
434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  39.77 
 
 
419 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  33 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  32.6 
 
 
431 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  34.66 
 
 
452 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 
420 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 
428 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  34.01 
 
 
426 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  36.72 
 
 
421 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  36.72 
 
 
421 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  30.64 
 
 
419 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  36.52 
 
 
421 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  35.53 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  37.94 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  32.59 
 
 
451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 
451 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 
453 aa  166  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  35.86 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  29.35 
 
 
419 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
436 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  30.29 
 
 
420 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  29.95 
 
 
420 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  29.46 
 
 
419 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
417 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  29.46 
 
 
419 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  29.87 
 
 
417 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  30.59 
 
 
419 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  30.59 
 
 
419 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  30.59 
 
 
419 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  35.56 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  29.95 
 
 
415 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  29.95 
 
 
415 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  29.95 
 
 
415 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  29.95 
 
 
415 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  30.93 
 
 
451 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  29.83 
 
 
422 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  29.98 
 
 
420 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  31.11 
 
 
426 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  30.53 
 
 
439 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  29.82 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 
453 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  30.67 
 
 
386 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  31.87 
 
 
446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
452 aa  122  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  30.27 
 
 
372 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  21.08 
 
 
473 aa  63.9  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  24.81 
 
 
472 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
395 aa  60.5  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  25.1 
 
 
495 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  24.9 
 
 
491 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  23.67 
 
 
456 aa  54.3  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  26.05 
 
 
465 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  23.67 
 
 
454 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  23.67 
 
 
454 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  24.22 
 
 
453 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  24.9 
 
 
493 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  24.51 
 
 
496 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  23.42 
 
 
454 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.58 
 
 
394 aa  53.5  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  23.68 
 
 
454 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  24.51 
 
 
452 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
407 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  24.31 
 
 
496 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  23.68 
 
 
454 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.15 
 
 
532 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  33.96 
 
 
452 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  23.68 
 
 
454 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  23.42 
 
 
454 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  25.87 
 
 
531 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  25.1 
 
 
527 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  34.23 
 
 
454 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  28.92 
 
 
531 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4140  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 
505 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  28.31 
 
 
531 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  24.71 
 
 
626 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  28.83 
 
 
548 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>