71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3541 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  100 
 
 		 431 aa  859    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 432 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  35.01 
 
 		 417 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 424 aa  222  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  41.19 
 
 		 407 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 420 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 426 aa  206  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  36.7 
 
 		 421 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  36.7 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  36.7 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 442 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 420 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 425 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  34 
 
 		 418 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  35.05 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 		 438 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 		 421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 419 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 419 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 419 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 419 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 420 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 438 aa  150  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 419 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  27.75 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  30.1 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 417 aa  143  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 410 aa  143  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 417 aa  143  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 451 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 422 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  26.37 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 453 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 451 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  28.25 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  24.12 
 
 		 372 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  24.02 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.15 
 
 		 510 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 467 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>