172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2419 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 438 aa  862    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  94.04 
 
 		 439 aa  767    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  94.5 
 
 		 439 aa  768    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  80.58 
 
 		 434 aa  619  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  75.59 
 
 		 439 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  75.71 
 
 		 442 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  72.5 
 
 		 420 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  62.35 
 
 		 432 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  61.95 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  61.88 
 
 		 425 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  62.95 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  62.6 
 
 		 411 aa  434  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  62.31 
 
 		 420 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  55.63 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  57.25 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  65.26 
 
 		 421 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  61.2 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  43.71 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 451 aa  279  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 		 453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  39.67 
 
 		 439 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  39.16 
 
 		 451 aa  249  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 446 aa  249  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 426 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 		 453 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 416 aa  245  9e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 421 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 421 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 421 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 426 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 		 420 aa  229  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  41.18 
 
 		 407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  33.81 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 410 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 417 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 		 411 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  32.7 
 
 		 420 aa  193  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  33.49 
 
 		 415 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 415 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 415 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 415 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 449 aa  190  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 420 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  33.9 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  31.81 
 
 		 372 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  29.08 
 
 		 473 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  21.9 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07936  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01520)  24.2 
 
 		 504 aa  53.5  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 487 aa  53.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 489 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 488 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.87 
 
 		 495 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.06 
 
 		 478 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.87 
 
 		 495 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.06 
 
 		 484 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 497 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.06 
 
 		 478 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1647  hypothetical protein  30.63 
 
 		 441 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411737  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 496 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.65 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.24 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.54 
 
 		 517 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 490 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.43 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 511 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.23 
 
 		 504 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  22.95 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 539 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.25 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  19.51 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.19 
 
 		 495 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 500 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>