231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3123 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  99.56 
 
 		 451 aa  881    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  94.04 
 
 		 453 aa  809    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  100 
 
 		 451 aa  884    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  68.76 
 
 		 451 aa  528  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  60.22 
 
 		 453 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  63.05 
 
 		 446 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  55.09 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  50.34 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  51.31 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  55.21 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  49.5 
 
 		 419 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  49.12 
 
 		 417 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  51.02 
 
 		 419 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  48.87 
 
 		 417 aa  349  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  49.13 
 
 		 420 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  49.37 
 
 		 419 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  49.25 
 
 		 419 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  49.25 
 
 		 419 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  49.25 
 
 		 419 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 419 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  46.99 
 
 		 420 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  49.62 
 
 		 415 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 415 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 415 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  48.74 
 
 		 422 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 415 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  48.99 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  42.18 
 
 		 417 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  45.26 
 
 		 452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 439 aa  273  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 420 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 		 439 aa  266  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 		 411 aa  266  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 423 aa  260  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  48.17 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 424 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 442 aa  255  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 434 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 438 aa  251  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  39.69 
 
 		 418 aa  250  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 420 aa  250  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 		 436 aa  226  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 421 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 421 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 421 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  35.48 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 410 aa  169  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 449 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 426 aa  150  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  27.71 
 
 		 431 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  30.79 
 
 		 405 aa  136  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  24.44 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.06 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 678 aa  57.4  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0091  hypothetical protein  29.06 
 
 		 277 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  31.61 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  31.61 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  31.61 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  31.61 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  29.1 
 
 		 400 aa  53.5  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 392 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 494 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.89 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  21.86 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 453 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 243 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>