145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6619 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  85.62 
 
 		 453 aa  731    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  100 
 
 		 446 aa  860    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  61.95 
 
 		 451 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  62.17 
 
 		 451 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  63.78 
 
 		 453 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  63.86 
 
 		 451 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  55.4 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  52.56 
 
 		 439 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  52.57 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  53.44 
 
 		 386 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  49.75 
 
 		 419 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  50 
 
 		 417 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  49.49 
 
 		 417 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  48.5 
 
 		 419 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  48.5 
 
 		 419 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  48.5 
 
 		 419 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  47.5 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  47.5 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  49 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  48.24 
 
 		 419 aa  320  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  48.74 
 
 		 415 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  48.74 
 
 		 415 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  48.74 
 
 		 415 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  48.74 
 
 		 415 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  48.26 
 
 		 422 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  46.31 
 
 		 420 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  43.48 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  44.87 
 
 		 452 aa  280  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 420 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  42.05 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 		 442 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 423 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  47.04 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 425 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 424 aa  246  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  38.72 
 
 		 418 aa  244  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  40.88 
 
 		 434 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 420 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 436 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  40.3 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 420 aa  173  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 421 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 421 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  36.09 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 452 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 426 aa  146  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 410 aa  146  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 449 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  27.29 
 
 		 431 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  32.92 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 		 428 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  24.07 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 539 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 391 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  30 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  27.61 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.63 
 
 		 401 aa  50.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 678 aa  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  28.22 
 
 		 492 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  29.1 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.84 
 
 		 401 aa  48.5  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.03 
 
 		 685 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0091  hypothetical protein  27.48 
 
 		 277 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1795  putative multidrug resistance protein  34.85 
 
 		 191 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 516 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 498 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 390 aa  47  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.48 
 
 		 478 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.57 
 
 		 504 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 407 aa  46.6  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  26.17 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  29.49 
 
 		 488 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.03 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  30 
 
 		 528 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>