122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4332 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  100 
 
 		 424 aa  826    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  92.65 
 
 		 425 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  84.85 
 
 		 421 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  77.36 
 
 		 419 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  62.98 
 
 		 424 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  64.69 
 
 		 442 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  61.68 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  60.91 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  62.15 
 
 		 439 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  64.18 
 
 		 411 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  61.92 
 
 		 439 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  61.45 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  62.95 
 
 		 438 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  63.59 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  61.46 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  64.39 
 
 		 420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  60.61 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  48.08 
 
 		 423 aa  363  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  46.12 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 416 aa  276  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  40.92 
 
 		 439 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 433 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 451 aa  249  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 446 aa  245  8e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 453 aa  242  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 386 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  42.61 
 
 		 421 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 419 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 403 aa  227  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  40.37 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 		 417 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 417 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 419 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  36.04 
 
 		 431 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 420 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 411 aa  219  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  36.43 
 
 		 420 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 438 aa  217  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  36.41 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  39.64 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 428 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 420 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  37 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  34.99 
 
 		 372 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  29.22 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  20.41 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  26.85 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  26.85 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  26.85 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  26.85 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  26.85 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 457 aa  49.7  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.03 
 
 		 478 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  27.17 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 489 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 584 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 462 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.68 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.68 
 
 		 484 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  26.91 
 
 		 394 aa  46.6  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.03 
 
 		 478 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.93 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.66 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  20.63 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  30.08 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 465 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.16 
 
 		 495 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>