126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1823 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  83.41 
 
 		 419 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  83.97 
 
 		 417 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  100 
 
 		 419 aa  824    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  84.5 
 
 		 417 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  83.14 
 
 		 420 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  83.65 
 
 		 419 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  83.65 
 
 		 419 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  83.65 
 
 		 419 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  85.1 
 
 		 420 aa  618  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  82.42 
 
 		 419 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  82.46 
 
 		 419 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  86.67 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  86.67 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  86.67 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  86.24 
 
 		 422 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  86.67 
 
 		 420 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  86.67 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  86.27 
 
 		 372 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  53.25 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  51.02 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  51.02 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  51.24 
 
 		 439 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  49.38 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  51.26 
 
 		 416 aa  353  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  51.6 
 
 		 452 aa  344  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  50.5 
 
 		 451 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  51.99 
 
 		 386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  48.35 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  46.25 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 432 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  35.37 
 
 		 417 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 420 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 424 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  35.98 
 
 		 418 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 436 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 439 aa  207  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 439 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 420 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 433 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 438 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 428 aa  193  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  36.29 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  29.83 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 		 417 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 421 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 421 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  31.07 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  32.35 
 
 		 473 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  21.05 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49971  predicted protein  21.77 
 
 		 957 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  24.01 
 
 		 456 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.72 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3535  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156699  normal  0.255134 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 		 615 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 539 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04260  hypothetical protein  27 
 
 		 479 aa  47  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.954801  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 442 aa  47  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  25 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  22.22 
 
 		 447 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1647  hypothetical protein  34.07 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411737  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  23.03 
 
 		 494 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.45 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>