More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3535 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3535  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 406 aa  817    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156699  normal  0.255134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2429  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00087995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1089  multidrug resistance transporter, Bcr family  28.86 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1712  multidrug resistance transporter, Bcr family  34.6 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  28.39 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.55 
 
 		 469 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 415 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0846  multidrug resistance transporter, Bcr family  31.6 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.687428  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.39 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  27.03 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.64 
 
 		 412 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.7 
 
 		 391 aa  119  7e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.82 
 
 		 416 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.52 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.51 
 
 		 402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  32.89 
 
 		 416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.52 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.51 
 
 		 402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02683  hypothetical protein  30.36 
 
 		 401 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  32.89 
 
 		 416 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.89 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.89 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.89 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.89 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.89 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  32.89 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002976  SERP1947  tcaB protein  27.14 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.13 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.19 
 
 		 437 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
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NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.66 
 
 		 425 aa  113  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32 
 
 		 398 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.42 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  28.01 
 
 		 420 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.96 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598733  normal  0.403775 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_5245  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.81 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.51 
 
 		 461 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.81 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
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NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.06 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.69 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.15 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_1367  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.96 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.45 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.27 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2360  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.72 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.52 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.88 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_002976  SERP2014  bicyclomycin resistance protein  26 
 
 		 399 aa  106  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0373482  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.12 
 
 		 417 aa  106  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_3304  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  26.98 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.14 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.11 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.76 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.81 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.29 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.1 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.08 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  29.35 
 
 		 404 aa  104  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.72 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.17 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.1 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  28.49 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  33.69 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.33 
 
 		 403 aa  103  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.5 
 
 		 403 aa  103  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.29 
 
 		 401 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.84 
 
 		 396 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.74 
 
 		 411 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1377  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.35 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.67 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.86 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  27.75 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  28.19 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.39 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.03 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.82 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.34 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.82 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.82 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  25.07 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0527  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.92 
 
 		 419 aa  99.8  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  25.73 
 
 		 392 aa  100  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  33.68 
 
 		 400 aa  100  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.24 
 
 		 407 aa  99.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  26.46 
 
 		 386 aa  99.8  8e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.52 
 
 		 399 aa  99.8  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  29.86 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  31.9 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.86 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.49 
 
 		 498 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  24.3 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.92 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  24.28 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.07 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3301  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.15 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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