More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3808 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  95.42 
 
 		 415 aa  792    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  96.4 
 
 		 469 aa  793    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  86.4 
 
 		 420 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  95.66 
 
 		 415 aa  776    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  827    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  827    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  94.94 
 
 		 415 aa  770    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  28.06 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0846  multidrug resistance transporter, Bcr family  29.78 
 
 		 410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.687428  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1089  multidrug resistance transporter, Bcr family  27.82 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.09 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1712  multidrug resistance transporter, Bcr family  31.13 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.64 
 
 		 401 aa  147  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.38 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3535  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 406 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156699  normal  0.255134 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.28 
 
 		 393 aa  142  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  28.89 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  30.09 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  28.49 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  31.12 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2429  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00087995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.18 
 
 		 465 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  28.39 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.23 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  30.82 
 
 		 393 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.31 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.82 
 
 		 393 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  29.19 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.86 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.72 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  28.5 
 
 		 414 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  29.37 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.77 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  28.09 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  29.34 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.7 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.83 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  34.62 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.35 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  27.48 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.35 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.56 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.35 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.48 
 
 		 396 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.48 
 
 		 396 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.78 
 
 		 405 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  26.3 
 
 		 410 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  27.48 
 
 		 410 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  27.48 
 
 		 410 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.82 
 
 		 393 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.4 
 
 		 434 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.26 
 
 		 410 aa  126  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.36 
 
 		 411 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.7 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.98 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.25 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1989  multidrug resistance protein D  27.98 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.7 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.49 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  26.86 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2389  multidrug resistance protein D  28.42 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  25.77 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.76 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.36 
 
 		 399 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.92 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.86 
 
 		 394 aa  124  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.36 
 
 		 399 aa  124  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.36 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  25.77 
 
 		 407 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4430  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.71 
 
 		 454 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0528088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  33.08 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.9 
 
 		 458 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.9 
 
 		 405 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.57 
 
 		 411 aa  123  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.9 
 
 		 405 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.27 
 
 		 417 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.61 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.75 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2999  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.63 
 
 		 408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.0320436 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  37.79 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  28.75 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  33.77 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.41 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.41 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.41 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.41 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  27.41 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.41 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.47 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.47 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.47 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.47 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 411 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0871  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.71 
 
 		 404 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.18 
 
 		 411 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.18 
 
 		 411 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.93 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>