More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1936 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2389  multidrug resistance protein D  89.86 
 
 		 414 aa  722    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  82.83 
 
 		 410 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  100 
 
 		 414 aa  816    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  99.76 
 
 		 414 aa  815    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  82.28 
 
 		 410 aa  656    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1989  multidrug resistance protein D  94.92 
 
 		 414 aa  774    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209754 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  84.06 
 
 		 422 aa  655    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  81.86 
 
 		 410 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  82.07 
 
 		 410 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  66.5 
 
 		 408 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  68.89 
 
 		 408 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  45.31 
 
 		 400 aa  331  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  43.11 
 
 		 401 aa  316  6e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  41.94 
 
 		 401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  41.9 
 
 		 414 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  43.37 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4245  multidrug resistance protein D  42.23 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0030  multidrug/H+ antiporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.62 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4008  multidrug resistance protein D  43.63 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4129  multidrug resistance protein D  43.63 
 
 		 386 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.771712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4024  multidrug resistance protein D  43.59 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4079  multidrug resistance protein D  43.59 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4187  multidrug resistance protein D  43.34 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5105  multidrug resistance protein D  42.17 
 
 		 396 aa  244  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.336287 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4039  multidrug resistance protein D  42.17 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03557  multidrug efflux system protein  42.17 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4181  multidrug resistance protein D  42.17 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0027  multidrug resistance protein D  42.17 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3886  multidrug resistance protein D  42.17 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03500  hypothetical protein  42.17 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0023  multidrug resistance protein D  42.41 
 
 		 394 aa  229  8e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  30.46 
 
 		 407 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  30.46 
 
 		 407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.57 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.75 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.53 
 
 		 418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.48 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.21 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.59 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  28.77 
 
 		 394 aa  143  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  31.16 
 
 		 394 aa  143  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  30.31 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.96 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  32.17 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.8 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  27.39 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  32.31 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.65 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.83 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  30.42 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.55 
 
 		 469 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  28.49 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 415 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 415 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 415 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  26.72 
 
 		 420 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.37 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.38 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.33 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.3 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.08 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.68 
 
 		 409 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.12 
 
 		 405 aa  127  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.36 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.98 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  30.59 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.84 
 
 		 398 aa  122  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.53 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  27.17 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.18 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  28.86 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.45 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  28.29 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  26.68 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  28.57 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  27.33 
 
 		 426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.6 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.32 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.47 
 
 		 416 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.07 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  30 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.52 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.06 
 
 		 461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.64 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.46 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  28.79 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.3 
 
 		 398 aa  120  6e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  29.3 
 
 		 398 aa  120  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.51 
 
 		 424 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3304  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  30.7 
 
 		 412 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.3 
 
 		 437 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0437  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.66 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.26 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.54 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.54 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.18 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.92 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>