More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03557 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03557  multidrug efflux system protein  100 
 
 
394 aa  775    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0030  multidrug/H+ antiporter, major facilitator superfamily (MFS)  100 
 
 
383 aa  752    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4245  multidrug resistance protein D  99.49 
 
 
394 aa  771    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0027  multidrug resistance protein D  100 
 
 
394 aa  775    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4039  multidrug resistance protein D  99.75 
 
 
394 aa  773    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.679822 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4024  multidrug resistance protein D  92.89 
 
 
394 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03500  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  775    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4181  multidrug resistance protein D  100 
 
 
394 aa  775    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3886  multidrug resistance protein D  100 
 
 
394 aa  775    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4079  multidrug resistance protein D  92.89 
 
 
394 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5105  multidrug resistance protein D  99.49 
 
 
396 aa  773    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.336287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4187  multidrug resistance protein D  92.39 
 
 
394 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4129  multidrug resistance protein D  92.57 
 
 
386 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.771712  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4008  multidrug resistance protein D  92.31 
 
 
386 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0023  multidrug resistance protein D  86.29 
 
 
394 aa  568  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  72.08 
 
 
394 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  43.24 
 
 
400 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  40.72 
 
 
401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  42.51 
 
 
408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  41.53 
 
 
408 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  43.47 
 
 
410 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  44.24 
 
 
410 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  43.47 
 
 
410 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1989  multidrug resistance protein D  44.06 
 
 
414 aa  279  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209754 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  43.2 
 
 
410 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  42.67 
 
 
414 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  42.67 
 
 
414 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  42.97 
 
 
422 aa  277  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  40.98 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  41.51 
 
 
414 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2389  multidrug resistance protein D  43.54 
 
 
414 aa  266  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  28.98 
 
 
409 aa  171  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.44 
 
 
391 aa  169  6e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.56 
 
 
392 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  28.76 
 
 
397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  30.83 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  30.71 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  29.43 
 
 
387 aa  143  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.25 
 
 
394 aa  143  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  29.97 
 
 
400 aa  142  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  29.04 
 
 
403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  27.58 
 
 
407 aa  132  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.43 
 
 
401 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.73 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.56 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1763  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.52 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5459  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.77 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243673  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.78 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  27.32 
 
 
407 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.69 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.29 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.24 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.5 
 
 
400 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.68 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.89 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.89 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.89 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.89 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.92 
 
 
405 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.71 
 
 
396 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.31 
 
 
411 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  32.18 
 
 
392 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  32.18 
 
 
392 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.18 
 
 
395 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.53 
 
 
400 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.91 
 
 
400 aa  123  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  29.97 
 
 
398 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1144  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.69 
 
 
395 aa  122  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.11 
 
 
417 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.09 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.92 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  27.93 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.61 
 
 
410 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.78 
 
 
401 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.22 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1677  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.28 
 
 
401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.701434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.87 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.85 
 
 
465 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.31 
 
 
424 aa  120  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  29.15 
 
 
393 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.15 
 
 
393 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.21 
 
 
402 aa  119  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  32.13 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.36 
 
 
405 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.81 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.67 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  27.84 
 
 
420 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  32.13 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.68 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.91 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  32.13 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.11 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.95 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.15 
 
 
405 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.57 
 
 
393 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.69 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5152  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.28 
 
 
413 aa  117  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.600108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.29 
 
 
399 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.43 
 
 
434 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  31.67 
 
 
415 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.134584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>