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for query gene Pput_2421 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3304  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  93.63 
 
 		 412 aa  724    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 416 aa  817    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2676  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  65.47 
 
 		 407 aa  478  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.37 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.17 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.6 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  34.22 
 
 		 426 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.23 
 
 		 409 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.53 
 
 		 405 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  33.07 
 
 		 420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2581  membrane transport protein  31.09 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324578  normal  0.102072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.63 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.86 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2514  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.86 
 
 		 397 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.03 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.05 
 
 		 412 aa  156  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 400 aa  154  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  33.33 
 
 		 414 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.57 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.02 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.55 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  35.46 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.75 
 
 		 405 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.62 
 
 		 411 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.55 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.75 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.55 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.23 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.75 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  31.23 
 
 		 392 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.45 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.65 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.65 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.68 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  32.86 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.95 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.95 
 
 		 418 aa  145  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  29.55 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.61 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  30.75 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.55 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  31.16 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00358  permease  30.97 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  29.82 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.86 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.42 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30 
 
 		 412 aa  143  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  28.97 
 
 		 400 aa  143  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.86 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.86 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.87 
 
 		 402 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.86 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
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NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.86 
 
 		 396 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.71 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.19 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.3 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.22 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.4 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.55 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  28.97 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.68 
 
 		 400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.21 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.67 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.64 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.46 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.24 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.09 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.65 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.65 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.65 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.82 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  28.65 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.65 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.42 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.65 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.9 
 
 		 419 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.66 
 
 		 412 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  29.5 
 
 		 408 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.79 
 
 		 419 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
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NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  29.39 
 
 		 400 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.92 
 
 		 394 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.95 
 
 		 465 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.21 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.56 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  30.23 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.67 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.06 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
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NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  28.25 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
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NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.33 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.13 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.12 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.67 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_009832  Spro_1190  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.22 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.33 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.33 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.3 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.01 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.61 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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