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for query gene Smed_1509 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 412 aa  806    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1935  MFS permease  59.75 
 
 		 401 aa  480  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  61.31 
 
 		 401 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  60.3 
 
 		 415 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  62.01 
 
 		 421 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.71 
 
 		 421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  61.74 
 
 		 421 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  57.14 
 
 		 415 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  50.9 
 
 		 422 aa  362  5.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  46.17 
 
 		 414 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.82 
 
 		 420 aa  342  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.44 
 
 		 418 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.15 
 
 		 417 aa  338  8e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.94 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 		 426 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.5 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.76 
 
 		 410 aa  319  6e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.96 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.19 
 
 		 411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 437 aa  312  7.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  43.86 
 
 		 423 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.1 
 
 		 425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.35 
 
 		 445 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.34 
 
 		 414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 		 461 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.06 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.19 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.19 
 
 		 422 aa  250  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  40.53 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.53 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 405 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.56 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 394 aa  235  8e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  39.43 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.24 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.58 
 
 		 405 aa  233  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  33.83 
 
 		 416 aa  232  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.45 
 
 		 410 aa  230  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  36.02 
 
 		 406 aa  229  7e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  37.72 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.18 
 
 		 414 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  39.38 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.22 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 397 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.426871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.52 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.15 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.14 
 
 		 424 aa  162  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.12 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.51 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  30.87 
 
 		 426 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32 
 
 		 394 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.45 
 
 		 412 aa  156  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.69 
 
 		 396 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.87 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.65 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.87 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.08 
 
 		 416 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.18 
 
 		 418 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  31.73 
 
 		 407 aa  153  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.18 
 
 		 412 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.78 
 
 		 405 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.82 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.81 
 
 		 414 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.82 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.82 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.69 
 
 		 398 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.13 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.13 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.13 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.13 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  30.13 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.13 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.45 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.11 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.11 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.33 
 
 		 408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.86 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.55 
 
 		 415 aa  146  8.000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.86 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
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NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.86 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  28.14 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  28.36 
 
 		 392 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.83 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  34.36 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.91 
 
 		 416 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.48 
 
 		 438 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.03 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.2 
 
 		 396 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2017  bicyclomycin resistance protein  30.54 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.470067  normal  1 
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.46 
 
 		 403 aa  143  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  30.14 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.75 
 
 		 418 aa  143  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.91 
 
 		 416 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.57 
 
 		 416 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.91 
 
 		 416 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.65 
 
 		 419 aa  142  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.87 
 
 		 400 aa  142  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.46 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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