More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4830 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 418 aa  818    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  50.84 
 
 		 422 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  47.72 
 
 		 414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.44 
 
 		 412 aa  338  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  46.94 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.75 
 
 		 420 aa  331  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  46.84 
 
 		 401 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.7 
 
 		 430 aa  326  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.79 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.07 
 
 		 421 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.32 
 
 		 421 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.94 
 
 		 411 aa  311  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1935  MFS permease  43.32 
 
 		 401 aa  309  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 423 aa  306  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.67 
 
 		 415 aa  302  7.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.32 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.67 
 
 		 425 aa  298  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.44 
 
 		 414 aa  293  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.8 
 
 		 426 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  41.52 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
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NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.19 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.01 
 
 		 430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
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NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.58 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
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NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.68 
 
 		 413 aa  262  8e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
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NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
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NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  37.41 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
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NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 394 aa  245  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.41 
 
 		 417 aa  242  7.999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  40.62 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
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NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.62 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.41 
 
 		 398 aa  229  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
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NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.36 
 
 		 422 aa  226  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  39.08 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
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NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  39.08 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.08 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
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NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  36.82 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.38 
 
 		 405 aa  216  8e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  33.85 
 
 		 416 aa  209  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.5 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
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NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.7 
 
 		 404 aa  196  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
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NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.09 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.426871 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.35 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
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NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.35 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
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NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.17 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.35 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.35 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.35 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.35 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
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NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  29.35 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.35 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.01 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.1 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.01 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.01 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.17 
 
 		 405 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.4 
 
 		 418 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.91 
 
 		 405 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.59 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.4 
 
 		 402 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.07 
 
 		 461 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.57 
 
 		 396 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.31 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.31 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.61 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.31 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.39 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.06 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.31 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  29.64 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.58 
 
 		 417 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.09 
 
 		 415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  29 
 
 		 401 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.61 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.06 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.93 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  30 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.93 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.73 
 
 		 394 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.86 
 
 		 424 aa  143  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.81 
 
 		 411 aa  143  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.81 
 
 		 412 aa  142  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.21 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.78 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.89 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.69 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.38 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.18 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.08 
 
 		 411 aa  137  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.41 
 
 		 392 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.75 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.49 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  31.41 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.51 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
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