More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0833 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 
421 aa  827    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  98.81 
 
 
421 aa  815    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  89.31 
 
 
421 aa  725    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  59.8 
 
 
401 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  59.05 
 
 
415 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  60.14 
 
 
412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1935  MFS permease  58.73 
 
 
401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  54.5 
 
 
415 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  49.62 
 
 
414 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.53 
 
 
417 aa  353  2e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  46.15 
 
 
426 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  45.91 
 
 
426 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.64 
 
 
422 aa  352  7e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.3 
 
 
420 aa  350  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.68 
 
 
430 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.79 
 
 
418 aa  333  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  44.36 
 
 
423 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.78 
 
 
428 aa  325  7e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  43.8 
 
 
425 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  39.86 
 
 
437 aa  312  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.22 
 
 
445 aa  312  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  43.6 
 
 
388 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  43.8 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.22 
 
 
430 aa  305  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.9 
 
 
411 aa  300  4e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.514561 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.12 
 
 
414 aa  298  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.226188 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.52 
 
 
425 aa  296  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.04 
 
 
410 aa  295  9e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.45 
 
 
422 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.29 
 
 
413 aa  262  8.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 
410 aa  252  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.46 
 
 
398 aa  250  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  33.33 
 
 
416 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.52 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  37.44 
 
 
407 aa  239  9e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.72 
 
 
405 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0246782 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  37.72 
 
 
405 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.07 
 
 
405 aa  236  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  32.16 
 
 
406 aa  229  7e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 
414 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256573 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  36.48 
 
 
402 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  39.1 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  34.63 
 
 
394 aa  219  7.999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.22 
 
 
404 aa  206  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.57 
 
 
424 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.32 
 
 
412 aa  196  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 
397 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.426871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.92 
 
 
417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.24 
 
 
411 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.48 
 
 
414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.51 
 
 
402 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.91 
 
 
401 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.91 
 
 
399 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.91 
 
 
399 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.92 
 
 
403 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.75 
 
 
399 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.32 
 
 
399 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.19 
 
 
399 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.06 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.59 
 
 
396 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.59 
 
 
396 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.59 
 
 
396 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.59 
 
 
396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.59 
 
 
396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.25 
 
 
408 aa  166  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  30.36 
 
 
392 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  30.36 
 
 
392 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.47 
 
 
396 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 
436 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.94 
 
 
412 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.47 
 
 
396 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.13 
 
 
458 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.68 
 
 
397 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.39 
 
 
396 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.9 
 
 
405 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.13 
 
 
405 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.94 
 
 
412 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  33.15 
 
 
404 aa  160  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.87 
 
 
405 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.12 
 
 
398 aa  159  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.95 
 
 
396 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.48 
 
 
461 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.68 
 
 
405 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.51 
 
 
398 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.75 
 
 
418 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.19 
 
 
399 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.61 
 
 
401 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.06 
 
 
405 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.06 
 
 
405 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  29.37 
 
 
426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.56 
 
 
394 aa  157  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.34 
 
 
434 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.47 
 
 
396 aa  156  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.47 
 
 
396 aa  156  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.47 
 
 
396 aa  156  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.47 
 
 
396 aa  156  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.47 
 
 
396 aa  156  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  30.47 
 
 
396 aa  156  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.18 
 
 
415 aa  156  8e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.179817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>