More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3226 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 428 aa  838    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  56.04 
 
 		 423 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  57.25 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  54.43 
 
 		 425 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  54.78 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  54.21 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  54.43 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.09 
 
 		 410 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.06 
 
 		 415 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.82 
 
 		 401 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.99 
 
 		 421 aa  316  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1935  MFS permease  46.35 
 
 		 401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.87 
 
 		 421 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.87 
 
 		 421 aa  313  5.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  43.97 
 
 		 414 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.49 
 
 		 422 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.52 
 
 		 426 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.96 
 
 		 412 aa  297  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
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NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.46 
 
 		 430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.68 
 
 		 420 aa  286  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.39 
 
 		 410 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.79 
 
 		 422 aa  274  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.49 
 
 		 413 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
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NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.62 
 
 		 415 aa  272  8.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.19 
 
 		 418 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
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NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.26 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.66 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.57 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
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NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.14 
 
 		 405 aa  259  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
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NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.66 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.42 
 
 		 414 aa  249  7e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.68 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
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NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  34.79 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
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NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  33.08 
 
 		 406 aa  232  9e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  37.44 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
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NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.73 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
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NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  39.01 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.01 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
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NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.11 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
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NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 397 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.426871 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.19 
 
 		 396 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.25 
 
 		 417 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.25 
 
 		 461 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.52 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  29.85 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.39 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.9 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.5 
 
 		 412 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.61 
 
 		 399 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.43 
 
 		 414 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.15 
 
 		 397 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.74 
 
 		 412 aa  139  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.38 
 
 		 399 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.13 
 
 		 424 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.97 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.34 
 
 		 409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.29 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.52 
 
 		 425 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.29 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.31 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.99 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.57 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.58 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.03 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1358  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 		 403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.42 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.45 
 
 		 405 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.21 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.87 
 
 		 406 aa  131  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  30.46 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.93 
 
 		 437 aa  130  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.53 
 
 		 396 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.53 
 
 		 396 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.41 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.41 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.41 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.41 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  29.37 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  26.41 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.41 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5245  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.94 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.47 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.94 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  27 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.27 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.22 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  33.11 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.55 
 
 		 436 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  30.63 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.88 
 
 		 401 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.82 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  30.81 
 
 		 392 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_4430  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.97 
 
 		 454 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0528088  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.48 
 
 		 396 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
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