More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2385 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 414 aa  816    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.74 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.76 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.36 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.44 
 
 		 426 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.72 
 
 		 418 aa  292  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.37 
 
 		 415 aa  292  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.63 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.12 
 
 		 421 aa  290  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.63 
 
 		 421 aa  282  6.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1935  MFS permease  40.75 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.21 
 
 		 412 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.4 
 
 		 420 aa  265  8e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.89 
 
 		 410 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.37 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  40.41 
 
 		 414 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.87 
 
 		 411 aa  263  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.26 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.27 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.65 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 461 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
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NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.99 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
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NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
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NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.88 
 
 		 422 aa  239  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.79 
 
 		 413 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
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NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  34.5 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.94 
 
 		 417 aa  219  7e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.37 
 
 		 398 aa  219  8.999999999999998e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
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NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.01 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.71 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.25 
 
 		 414 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
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NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  32.73 
 
 		 416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  37.54 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  34.48 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 405 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
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NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  34.26 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.26 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
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NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.93 
 
 		 410 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.02 
 
 		 404 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.51 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
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NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.51 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.82 
 
 		 399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.87 
 
 		 402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.82 
 
 		 401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.82 
 
 		 399 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.426871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.12 
 
 		 396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.12 
 
 		 396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.12 
 
 		 396 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.12 
 
 		 396 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.35 
 
 		 396 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.12 
 
 		 396 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  30 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  30 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  30 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  30 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  30 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.76 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.74 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.05 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.38 
 
 		 424 aa  159  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.35 
 
 		 461 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 412 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.9 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.72 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.86 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.71 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.71 
 
 		 418 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1629  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.57 
 
 		 406 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.09 
 
 		 410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.87 
 
 		 399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.75 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  29.4 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.33 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.81 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.65 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.27 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  30.29 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.68 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.17 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.75 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.6 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.17 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.17 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.17 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.03 
 
 		 498 aa  144  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  33.53 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.89 
 
 		 434 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2136  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.86 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.29 
 
 		 409 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_010506  Swoo_1956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.74 
 
 		 408 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  0.0575166 
 
 
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NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.95 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
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