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for query gene Sfri_1629 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1629  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 406 aa  803    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1974  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  80.05 
 
 		 407 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0583224  hitchhiker  0.00000495427 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2373  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  80.05 
 
 		 407 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.409175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2488  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  80.05 
 
 		 407 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0118329  hitchhiker  0.000775175 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  80.05 
 
 		 407 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2043  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  74.56 
 
 		 406 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.678536  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2136  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  79.58 
 
 		 406 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1751  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  77.69 
 
 		 407 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0172421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1831  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  78.39 
 
 		 407 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2268  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  77.69 
 
 		 407 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  73.82 
 
 		 407 aa  586  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  72.03 
 
 		 408 aa  586  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2280  bicyclomycin resistance protein  76.75 
 
 		 407 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2665  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  74.12 
 
 		 408 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126331  hitchhiker  0.00560959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1912  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  75.26 
 
 		 408 aa  565  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758085  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2017  bicyclomycin resistance protein  61.62 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.470067  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_4611  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  48.27 
 
 		 422 aa  352  5.9999999999999994e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  37.03 
 
 		 402 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.58 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.42 
 
 		 401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.42 
 
 		 399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.42 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.16 
 
 		 398 aa  193  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.28 
 
 		 396 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.28 
 
 		 396 aa  192  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
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NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.79 
 
 		 396 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.79 
 
 		 396 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.42 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
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NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.42 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.28 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.28 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.28 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.15 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.28 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.28 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  34.28 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.15 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.67 
 
 		 401 aa  189  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.29 
 
 		 393 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.31 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.76 
 
 		 397 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.95 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.75 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003780  permease  33.74 
 
 		 400 aa  179  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.52 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.17 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  30.93 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  32.8 
 
 		 392 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  32.8 
 
 		 392 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.61 
 
 		 405 aa  172  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.79 
 
 		 396 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.18 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.99 
 
 		 400 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.66 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.18 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.66 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.9 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.38 
 
 		 405 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 		 401 aa  169  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  29.72 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  32.08 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  34.02 
 
 		 392 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.69 
 
 		 403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1316  major facilitator superfamily permease  33.42 
 
 		 403 aa  162  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323105 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.9 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.26 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.41 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.97 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.08 
 
 		 370 aa  160  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.53 
 
 		 393 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  31.42 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.91 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.42 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.56 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.44 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.03 
 
 		 412 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3518  MFS permease  31.91 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.55 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.29 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.19 
 
 		 414 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.45 
 
 		 412 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  30.84 
 
 		 402 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.25 
 
 		 414 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.04 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3300  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.53 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.89 
 
 		 406 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.3 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.31 
 
 		 411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.08 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3096  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.51 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673947  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.34 
 
 		 424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.36 
 
 		 405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.03 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.04 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.8 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.59 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 389 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.75 
 
 		 412 aa  146  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.02 
 
 		 409 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.81 
 
 		 409 aa  146  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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